Elektronické volby se pořádají typicky tajné. U tajných voleb se nikomu, ani vyhlašovateli nesděluje, jak kdo hlasoval. Ovšem vyhlašovatel při vyhlašování volby může zapnout veřejnou volbu. Hlasující je o volbě přepnuté do tohoto režimu informován.
Je-li volba veřejná, zveřejňuje se po ukončení hlasování informace o tom, jak kdo hlasoval (tedy vč. jmen hlasujících a jejich hlasů). Pokud není volba označena jako veřejná, nezveřejňuje se seznam hlasujících ani jejich hlasy. A to ani osobě, která volbu vyhlašuje.
Informační systém zajišťuje, že jedna fyzická osoba má tolik hlasů, kolik stanovil vyhlašovatel volby, ověřuje identitu hlasujících, příslušnost k vybrané kategorii hlasujících a zajišťuje a garantuje anonymitu tajné volby. Anonymita tajné volby je mj. zajištěna jednoznačným pokynem provozovatelům Informačního systému, kteří nesmí identitu odpovídajících zveřejnit podobně jako u aplikací Studentské ankety.
1 Místo jména a příjmení osoby, která možnost volila, je vidět pouze osobní identifikátor pro tuto tajnou volbu.