Sekundární heslo AMBIS slouží pro ostatní služby, které využívají autentizačních prostředků IS AMBIS k ověření totožnosti uživatelů.
Toto heslo se používá všude tam, kde se nepřihlašujete přímo do IS AMBIS (doména islogin.cz) , např. přístup k poště IS AMBIS protokoly POP/IMAP a podobně.
Sekundární heslo je možné nastavit na základě znalosti primárního hesla přímo v IS AMBIS na stejném místě, kde lze měnit i primární heslo: